萝卜烂心主要有三大方面原因：一是根组织缺氧，二是土壤缺硼，三是萝卜感染黑腐病
一、根组织缺氧所致的黑心
1、症状：切开萝卜可见肉质根木质部一些薄壁细胞变黑，而出现许多黑色小点，重时成片变黑，变黑部稍发硬，不能食用。黑心萝卜，有时在肉质根表面也出现灰黑色或黑色斑块，无光泽，影响萝卜商品性状。
2、发病原因：萝卜田如大量施用未腐熟或腐熟不好的有机肥，尤其是圈粪，会引起土壤中微生物活动旺盛，氧气消耗过多，从而造成根部窒息，部分组织因缺氧而发生黑皮或黑心。萝卜地长期湿度过大，或雨后长时间地块积水，也会导致根部缺氧窒息而发生黑皮或黑心。贮藏萝卜时，如窖内存放萝卜过多，又没有及时通风换气，因萝卜呼吸耗氧而造成窖内缺氧，诱发和加重黑心现象。
3、防治方法
①种植萝卜的地块要深翻、整平，保持土壤疏松，增强士壤通透性。
②萝卜喜有机肥，在施用有机肥时要充分腐熟，不要使用生圈粪。
③合理灌水，加强中耕，保持士壤通透性，萝卜根部有充足的氧气，促其健康生长。雨后及时排水，做到灌水后、雨后地面无积水，否则积水处极易出现黑皮和黑心。
④贮藏窖内存放萝卜要适量，不能超过窖容的1/2。要经常通风换气，控制较低窖温，保持稍低的湿度。
二、缺硼所致的黑心
1、症状：萝卜缺硼易黑心、空心、烂心，表皮开裂。
2、发病原因：一是由于土壤中缺硼。二是土壤中其它元素偏多，从而抑制了对硼元素的正常吸收。三是高温、干旱等条件，影响萝卜对硼元素的吸收。
3、防治萝卜缺硼空心症的措施：
A、基施硼肥。与秋播萝卜相比，春、夏种植的水萝卜生长期短，硼肥作基肥早施效果好。偏施氮、磷肥的田块，硼肥更应基施。一般每亩施硼砂300—400克。
B、生长期叶面补硼。一般缺硼的田块，采取生长期喷硼即可起到防空心的作用。从萝卜出现2—3片真叶至收获前，每隔10天左右喷一次施，共喷3次。可喷糖醇硼800倍水溶液，或0.2%浓度的硼酸或0.3%浓度的硼砂水溶液。用硼砂时要注意，以冷水直接溶解，容易出现“再结晶现象”，影响补硼。应先将硼砂用2-3公斤80℃以上热水化开，再加凉水至要求浓度，并立即喷施，以防出现“再结晶现象”。相对来说，糖醇硼溶解吸收比较好，建议使用糖醇硼。
C、除施用硼肥防萝卜空心外，及时浇水润田也十分重要。萝卜生长发育期，要保持土壤润湿适宜。土壤干旱缺墒，影响萝卜对硼的有效吸收。所以，要防止干旱，生长期及时灌水润土。
三、黑腐病引起的黑心
1、症状：该病是由细菌引起的病害。主要危害叶和根。幼苗期发病子叶呈水浸状，根髓变黑腐烂。叶片发病，叶缘多处产生黄色斑，后变“V”字形向内发展，叶脉变黑呈网纹状，逐渐整叶变黄干枯。病菌沿叶脉和维管束向短缩茎和根部发展，后使全株叶片变黄枯死。萝卜肉质根受浸染后，透过日光可看到暗灰色病变，横切萝卜可看到维管束呈放射线状、黑褐色，重者呈干缩空洞，维管束溢出菌脓，这一点与缺硼引起的生理性变黑不同。
2、发病条件：主要在秋季发生。在气温15℃—21℃，多雨、结露时间长时易发病。在十字花科蔬菜重茬、地势低洼、排水不良、播种早、发生虫害的地块发病较重。平均气温15℃时开始发病，15—28℃发病重，气温低于8℃停止发病，降雨20—30mm以上发病呈上升趋势，光照少发病重。此外，肥水管理不当，植株徒长或早衰，寄主处于感病阶段，害虫猖獗或暴雨频繁时发病重。
3、防治方法
A、避免与其他十字花科蔬菜连作。
B、选用抗病品种。
C、用福靓拌种，5毫升药液兑水适量拌种10斤，拌后晾干即播。（福靓为80%乙蒜素，系植物源农药，对真菌细菌引起的土传病害有较好防治作用）
D、及早防治黄条跳甲、蚜虫等害虫。
E、苗期预防，用福靓随水冲施，一亩用量500毫升，既可以预防根腐病，又可以预防烂心等黑腐病。
F、发病初期喷施祺克细可湿性粉剂800倍液，同时用福靓1000倍液灌根。每隔7-10天用药1次，连用2-3次。（祺克细为微生物菌剂，对细菌性病害有独特疗效）
